杀菌 shā jūn 杀死病菌。
细菌 xì jūn （名）微生物的一大类，体积微小，必须用显微镜才能看见，一般用分裂繁殖。
霉菌 méi jūn 霉菌（molds）其实并不是一个生物分类学的名称，而是一些丝状真菌的通称，可能属于真菌，也有可能属于放线菌门
带菌 dài jūn 指携带病菌。
菌落 jūn luò
抗菌素 kàng jūn sù 某些微生物
噬菌体 shì jūn tǐ 一种对细菌能产生溶解的病毒。
酿母菌 niàng mǔ jūn 酵母。真菌的一种，黄白色，圆形或卵形，内有细胞核﹑液泡等。酿酒﹑制酱﹑发面等都是利用酵母引起的化学变化。
真菌 zhēn jūn 生物界中的一大类，组成真菌门的成员。菌体为单细胞或由菌丝组成。无叶绿素，有完整的细胞核。主要靠菌丝体分解吸收现成的营养物质，通常寄生在其他物体上。自然界中分布很广，靠孢子繁殖。如酵母菌、青霉菌、蘑菇等。有些能使动植物致病。
球菌 qiú jūn 一种微生物。一种呈球形或近似球形的细菌。
益菌堂 yì jūn táng 以北京为中心，遍及全国各个省市。致力于致力于知识，同时经营各类微生态制剂、各种菌类产品及其制品。
雚菌 guàn jūn 一种菌类植物。可入药。
鸡菌 jī jūn 鸡菌是一种美味的伞菌。
槐菌 huái jūn 即槐耳。参见'槐?'。
菌阁 jūn gé 形如菌状之阁。
抗菌药物 kàng jūn yào wù 抗菌药物一般是指具有杀菌或抑菌活性的药物，包括各种抗生素、磺胺类、咪唑类、硝基咪唑类、喹诺酮类等化学合成药物。
无菌抹布 wú jūn mā bù 抹布 mābù 专用于擦地板或桌子的织物
黄耳菌 huáng ěr jūn 黄色的菌子。菌蕈形似人之耳朵，故称黄耳菌。
玉菌子 yù jùn zǐ 菌类植物名。以其柄白色，伞灰色，晶莹如玉，故名。
霍乱菌 huò luàn jūn 霍乱菌是引起人体消化道严重病患的弧菌。