明 代军队编制五十人为总旗，十人为小旗。
《明史·兵志二》：“天下既定，度要害地係一郡者设所，连郡者设卫，大率五千六百人为卫，千一百二十人为千户所，百十有二人为百户所，所设总旗二，小旗十，大小联比以成军。”
清 代屯军亦有“百户”、“总旗”等编制名称。
《清史稿·食货志一》：“ 嘉庆 初， 铜仁 、 石峴 苗 地建碉卡，置屯军，每军百名，设百户一，总旗二，每军一名予水田四亩，百户六亩，总旗五亩，皆免租。”