神木的根。
晋 孙拯 《赠陆士龙》诗：“制动以静，祕景在阴，灵根可栖，乐此隈岑。”
植物根苗的美称。
唐 柳宗元 《种术》诗：“戒徒斸灵根，封植閟天和。” 宋 司马光 《和昌言官舍十题·石榴花》：“灵根逐 汉 臣，远自 河 源至。” 明 陈所闻 《懒画眉·月下刘中明招赏牡丹》曲：“一丛凝露在沉香，移得灵根傍锦堂。” 清 秋瑾 《白梅》诗：“淡到罗浮忘色相，謫来尘世具灵根。”
指才德修养。
汉 扬雄 《太玄·养》：“藏心於渊，美厥灵根。” 范望 注：“灵根，道德也。” 宋 黄庭坚 《柳閎展如苏子瞻甥也其才德甚美作诗赠之》：“ 咸池 浴日月，深宅养灵根。”
指有才德的人。
宋 叶适 《祭徐文子侍郎文》：“于时侍郎，卓尔灵根，有光厥师，兼华众门。”
对祖先的敬称。
《文选·张衡＜南都赋＞》：“固灵根於 夏 叶，终 三代 而始蕃。” 李周翰 注：“ 刘累 自 夏 而迁於此，故云‘固灵根於 夏 叶’，终于 殷 周 秦 三代，然后 汉 兴乃蕃盛。”《文选·陆机＜叹逝赋＞》：“痛灵根之夙殞，怨具尔之多丧。” 刘良 注：“灵根，灵木之根，喻祖考也。” 唐 王勃 《广州宝庄严寺舍利塔碑》：“ 李公 ，天子之旧族，朝廷之夙将也。灵根自远，圣族多奇。”
指佛祖。
清 龚自珍 《己亥杂诗》之八二：“ 龙树 灵根派别三，家家楖栗不能担。” 刘逸生 注：“灵根，指佛祖，这里具指 龙树 。”
性灵，智慧。
清 陈天华 《论中国宜改创民主政体》：“ 中国 经二十餘朝之独夫民贼，闭塞其聪明，钳制其言论，灵根尽去，錮疾久成。”
道教指舌根。
《黄庭内景经·上有章》：“灌溉五华植灵根。” 务成子 注：“灵根，舌本也。” 宋 陆游 《病中作》诗：“不忧竖子居肓上，已见真人出面门。力守谁能发底火？深潜自足美灵根。”
借指人的身体。
《文选·陆机＜君子有所思行＞》：“宴安消灵根，酖毒不可恪。” 吕延济 注：“《黄庭经》云：‘玉池清水灌灵根，灵根坚固老不衰。’然灵根喻身也。” 唐 吴筠 《览古》诗之六：“荒淫伐灵根，金膏恃延期。”
10.仙缘。
明 屠隆 《綵毫记·游玩月宫》：“天子与贵妃尘中虽已造业，灵根尚未消尽。”